Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Chmp3Q9CQ10 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Chmp3Q9CQ10 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms