Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

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Length 279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nsmce3Q9CPR8 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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Nsmce3Q9CPR8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
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