Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR1

Rwdd4, RWD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd4Q9CPR1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rwdd4Q9CPR1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rwdd4Q9CPR1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms