Protein–RNA interactions for Protein: Q99PT3

Ino80b, INO80 complex subunit B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ino80bQ99PT3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ino80bQ99PT3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ino80bQ99PT3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms