Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ubxn6Q99PL6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ubxn6Q99PL6 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms