Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trem2Q99NH8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trem2Q99NH8 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms