Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Cep41Q99NF3 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
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