Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Sf3b1Q99NB9 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms