Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Atoh8Q99NA2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms