Protein–RNA interactions for Protein: Q99N13

Hdac9, Histone deacetylase 9, mousemouse

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac9Q99N13 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Hdac9Q99N13 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Hdac9Q99N13 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms