Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Atp1b4Q99ME6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms