Protein–RNA interactions for Protein: Q99LE6

Abcf2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf2Q99LE6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcf2Q99LE6 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcf2Q99LE6 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms