Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
TriobpQ99KW3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TriobpQ99KW3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms