Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Q99KU6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Q99KU6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q99KU6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q99KU6 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q99KU6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ 0
Q99KU6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q99KU6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Q99KU6 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Q99KU6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Q99KU6 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms