Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Prpf19Q99KP6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms