Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY6

Higd1b, HIG1 domain family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1bQ99JY6 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Higd1bQ99JY6 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms