Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pacsin3Q99JB8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms