Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ddb2Q99J79 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Ddb2Q99J79 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
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Ddb2Q99J79 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms