Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tspan1Q99J59 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan1Q99J59 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tspan1Q99J59 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms