Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
CsprsQ99388 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CsprsQ99388 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms