Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
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Cldn16Q925N4 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn16Q925N4 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn16Q925N4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn16Q925N4 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Cldn16Q925N4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cldn16Q925N4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Cldn16Q925N4 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Cldn16Q925N4 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Cldn16Q925N4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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