Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Trim7Q923T7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Trim7Q923T7 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Trim7Q923T7 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms