Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spdl1Q923A2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms