Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Prpf3Q922U1 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Prpf3Q922U1 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms