Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Clip1Q922J3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms