Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tubb6Q922F4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms