Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
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Afg3l1Q920A7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Afg3l1Q920A7 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Afg3l1Q920A7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Afg3l1Q920A7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Afg3l1Q920A7 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Afg3l1Q920A7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Afg3l1Q920A7 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Afg3l1Q920A7 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Afg3l1Q920A7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Afg3l1Q920A7 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Afg3l1Q920A7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Afg3l1Q920A7 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Afg3l1Q920A7 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Afg3l1Q920A7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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