Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Smarca5Q91ZW3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Smarca5Q91ZW3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms