Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Nek8Q91ZR4 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Nek8Q91ZR4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms