Protein–RNA interactions for Protein: Q91YY4

Atpaf2, ATP synthase mitochondrial F1 complex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atpaf2Q91YY4 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atpaf2Q91YY4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms