Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rrp1bQ91YK2 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rrp1bQ91YK2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms