Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Lims2Q91XD2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms