Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm44044-201ENSMUST00000205178 1089 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Usp3Q91W36 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms