Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ5

Mark1, Serine/threonine-protein kinase MARK1, mousemouse

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mark1Q8VHJ5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mark1Q8VHJ5 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms