Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Q8VDP2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Q8VDP2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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