Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDF2

Uhrf1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1Q8VDF2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Uhrf1Q8VDF2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Uhrf1Q8VDF2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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