Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDC1

Fyco1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fyco1Q8VDC1 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Fyco1Q8VDC1 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fyco1Q8VDC1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms