Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nae1Q8VBW6 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nae1Q8VBW6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nae1Q8VBW6 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nae1Q8VBW6 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nae1Q8VBW6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nae1Q8VBW6 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nae1Q8VBW6 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nae1Q8VBW6 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nae1Q8VBW6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nae1Q8VBW6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nae1Q8VBW6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nae1Q8VBW6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nae1Q8VBW6 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Nae1Q8VBW6 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nae1Q8VBW6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms