Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BbxQ8VBW5 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms