Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D5

Trpm8, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm8Q8R4D5 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trpm8Q8R4D5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Trpm8Q8R4D5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trpm8Q8R4D5 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trpm8Q8R4D5 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trpm8Q8R4D5 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trpm8Q8R4D5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trpm8Q8R4D5 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trpm8Q8R4D5 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Trpm8Q8R4D5 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trpm8Q8R4D5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trpm8Q8R4D5 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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