Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ccdc12Q8R344 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ccdc12Q8R344 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms