Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0J7

Vps37b, Vacuolar protein sorting-associated protein 37B, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37bQ8R0J7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vps37bQ8R0J7 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vps37bQ8R0J7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms