Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Hoxc12Q8K5B8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
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Hoxc12Q8K5B8 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxc12Q8K5B8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxc12Q8K5B8 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxc12Q8K5B8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Hoxc12Q8K5B8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Hoxc12Q8K5B8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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