Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
OptnQ8K3K8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms