Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
MyripQ8K3I4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
MyripQ8K3I4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms