Protein–RNA interactions for Protein: Q8K301

Ddx52, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX52, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx52Q8K301 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ddx52Q8K301 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ddx52Q8K301 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ddx52Q8K301 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Ddx52Q8K301 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ddx52Q8K301 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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