Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z2

Prpf39, Pre-mRNA-processing factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf39Q8K2Z2 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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Prpf39Q8K2Z2 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Prpf39Q8K2Z2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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