Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Otud6bQ8K2H2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Otud6bQ8K2H2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms