Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sh2d5Q8JZW5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms