Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Slc4a8Q8JZR6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc4a8Q8JZR6 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc4a8Q8JZR6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc4a8Q8JZR6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc4a8Q8JZR6 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc4a8Q8JZR6 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc4a8Q8JZR6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc4a8Q8JZR6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc4a8Q8JZR6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc4a8Q8JZR6 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Slc4a8Q8JZR6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc4a8Q8JZR6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Slc4a8Q8JZR6 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms